L’edificio costituisce un prodotto originale, frutto dell’incontro di tendenze differenti: romano-ellenistica, bizantina, longobarda e locale. Per questo incarna quel carattere di pluralismo culturale che è peculiare dell’altomedioevo - in tutte le sue espressioni - e che costituirà il fondamento dell’Europa medievale. Ha un impianto a tre navate, con presbiterio tripartito che, nella zona centrale, è coperto da una struttura a volta su base ottagonale.
I due ambulacri absidati ai lati dell’abside la sopravanzano in lunghezza e creano sul retro un effetto di facciata. Della decorazione interna rimangono tracce di stucchi in controfacciata ed alcuni elementi dell'apparato pittorico.
Sul fondo della nicchia centrale è dipinta una croce gemmata dalle cui braccia pendono delle catenelle con l’A e l’Ω. Nella facciata le tre finestre centrali risultano scandite da pilastrini scanalati con capitelli a motivi fitomorfi e sormontate da frontoncini. I tre portali sono definiti da cornici con motivi classici e sormontati da una trabeazione riccamente lavorata, fiancheggiata da grandi volute. Caratteristica peculiare di San Salvatore è la fortissima presenza degli spolia, la cui utilizzazione assume una duplice connotazione, considerato che alcune parti vengono reimpiegate in quanto tali (colonne, basi, capitelli, architrave interno), mentre altre subiscono radicali rilavorazioni (elementi decorativi della facciata, cornice nel presbiterio e dadi all’imposta della cupola).
